В прошлом башкиры накопили определенный опыт и навыки в использовании природных богатств края. Они владели простейшей технологией выплавки и обработки металлов, знали целебные свойства растений и продуктов животноводства. Башкирские рудознатцы оказали видную помощь в разведке рудных месторождений при строительстве заводов в XVII – XVIII веках. Лучшие достижения народной медицины (например, кумысолечение) применяются в современной врачебной практике. Некоторым башкирам даже в условиях дореволюционной России удавалось получить образование и вести научные изыскания. В XVIII в. башкир И. Тасимов явился инициатором основания Горной академии в Петербурге. Во второй половине XIX века появляется ряд ученых просветителей, которые внесли заметный вклад в изучение исторического прошлого, нравов и обычаев башкирского народа, культуры и языка. Среди них М. Бикчурин, автор пособия по изучению восточных языков и составитель сравнительно1 о словаря башкирского языка, М. Куватов и С. Батыршин, опубликовавшие образцы башкирского фольклора, этнографы М Баишов и Б. Юлуев, разносторонний ученый и писатель М. Уметбаев. В начале XX в. М. Султанов собирал произведения народной музыки и издал сборник башкирских и татарских мелодий. Врач и филолог М. Кулаев разработал оригинальную азбуку для башкир на базе русской графики и составил грамматику башкирского языка по типу европейских.
В 30-е годы XX в. сделала большие шаги наука в Башкортостане. В 1930 г. был создан Башкирский комплексный научно-исследовательский институт, а в 1931 – 1932 годах было организовано несколько научных центров: Башкирский научно-исследовательский институт социалистической реконструкции сельского хозяйства и Почвенно-ботанический институт, Башкирский научно-исследовательский институт национальной культуры, Институт марксистко-ленинской педагогики и Научно-исследовательский институт промышленности.
Большое значение для развития научных исследований в республике имело создание в 1951 г Башкирского филиала Академии наук СССР, который объединил Горно-геологический и Биологический институты, Институт истории языка и литературы, а также отделы органической химии и экономических исследований. Позднее были организованы самостоятельный Институт химии, отделы биохимии и цитохимии, физики и математики, Ботанический сад.
Научные изыскания ведутся во всех вузах, многочисленных отраслевых научно-исследовательских институтах. В научных учреждениях и вузах работает более 250 докторов и 2,5 тыс. кандидатов наук. Ученые Башкортостана добились значительных результатов в изучении геологического строения края, в разведке нефтяных, газовых и рудных месторождений, в исследовании биологии растений и выведении высокоурожайных культур. Многие технологические процессы в промышленности, особенно в нефтепереработке и нефтехимии, впервые разработаны в Башкортостане. К крупным достижениям общественных наук в республике относятся фундаментальные исследования по истории края и его коренного населения – башкир, по башкирской филологии, археологии, этнографии и фольклористике Башкирский народ выдвинул из своей среды целый ряд талантливых ученых, внесших определенный вклад в развитие науки. Широко известны в республике и в стране имена доктора геолого-минералогических наук К. Р Тимергазина, профессоров-лингвистов Дж. Киекбаева и К. Ахмерова, члена-корреспондента АН СССР С. Рафикова, доктора экономических наук Г. Хамидуллина, доктора исторических наук Р. Г. Кузеева, доктора биологических наук М. Бурангуловой, докторов сельскохозяйственных наук В. Г. Гирфанова и С. Тайчинова, врача-офтальмолога профессора Г. X. Кудоярова, профессоров-филологов А. Н. Хари-сова, А. Н. Киреева, Г. Б. Хусаинова и других.